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目前，實驗室級別的制備液相色譜主要用于以下領域：
1.天然藥物化學、中藥化學。這是國內目前廣泛的使用方法，為了弄清楚植物中的微量有效成分，開放手工色譜柱早已不夠用了，幾乎每個搞天然藥化的實驗室都至少有一臺液相，土豪實驗室人手一臺液相。
2.蛋白純化。相對于前者，蛋白純化的起步要稍微晚一點，但是發展很迅速。同時，由于外國儀器廠家在這個領域的優勢不算太大，目前國內也在這個領域加快發展，搶占地盤。
3.藥物雜質純化。由于合成工藝并不能做到100%的產率，往往伴有副產品，如何獲得微量的雜質并確定結構和含量，這就得靠液相色譜。
4.手性化合物的制備。這個主要是有機合成和方法學的在用。
總之，目前有機化學領域里，開放手工柱層析依然是常用的分離手段，也是每個有機狗必會的技能之一，其在未來很長一段時間里將仍然扮演重要的角色。制備液相已經在天然藥化領域大面積使用，在將來，隨著科研的需要和價格的下降，將會逐漸進入千家萬戶，終跟旋蒸一樣普及。
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